Elektroforesis gel bisa ditindakake kanthi orientasi horisontal utawa vertikal. Gel vertikal umume kasusun saka matriks akrilamida. Ukuran pori saka gel iki gumantung ing konsentrasi komponen kimia: pori gel agarose (diameteripun 100 kanggo 500 nm) luwih gedhe lan kurang seragam dibandhingake karo acrylamide gelpores (diameteripun 10 kanggo 200 nm). Secara komparatif, molekul DNA lan RNA luwih gedhe tinimbang untaian protein linier, sing asring didenaturasi sadurunge, utawa sajrone proses iki, supaya luwih gampang dianalisis. Mangkono, protein mbukak ing gel acrylamide (vertikal).DYCZ - 24DN punika mini elektroforesis vertikal dual ditrapake kanggo SDS-PAGE lan native-PAGE. Nduwe fungsi casting gel ing posisi asli kanthi piranti casting gel sing dirancang khusus.
