Elektroforesis gel bisa ditindakake kanthi orientasi horisontal utawa vertikal.Gel horisontal biasane kasusun saka matriks agarose.Ukuran pori gel iki gumantung saka konsentrasi komponen kimia: pori gel agarose (diameter 100 nganti 500 nm) luwih gedhe lan kurang seragam dibandhingake karo pori gel akrilamida (diameter 10 nganti 200 nm).Secara komparatif, molekul DNA lan RNA luwih gedhe tinimbang untaian protein linier, sing asring didenaturasi sadurunge, utawa sajrone proses iki, supaya luwih gampang dianalisis.Mangkono, molekul DNA lan RNA luwih kerep dianggo ing gel agarose (horizontal).Sistem DYCP-31DN kita minangka sistem elektroforesis horisontal.Piranti casting gel iki bisa nggawe 4 macem-macem ukuran gel kanthi tray gel sing beda.
